Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBTB39O15060 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBTB39O15060 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBTB39O15060 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms