Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC80O14777 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC80O14777 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC80O14777 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC80O14777 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC80O14777 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC80O14777 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC80O14777 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC80O14777 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC80O14777 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDC80O14777 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDC80O14777 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDC80O14777 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDC80O14777 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDC80O14777 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms