Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PES1O00541 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PES1O00541 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PES1O00541 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PES1O00541 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PES1O00541 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PES1O00541 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PES1O00541 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PES1O00541 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PES1O00541 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PES1O00541 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PES1O00541 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PES1O00541 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PES1O00541 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PES1O00541 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PES1O00541 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PES1O00541 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PES1O00541 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PES1O00541 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PES1O00541 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PES1O00541 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PES1O00541 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PES1O00541 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PES1O00541 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PES1O00541 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PES1O00541 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PES1O00541 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PES1O00541 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PES1O00541 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PES1O00541 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PES1O00541 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PES1O00541 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PES1O00541 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PES1O00541 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PES1O00541 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PES1O00541 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PES1O00541 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PES1O00541 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PES1O00541 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PES1O00541 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PES1O00541 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PES1O00541 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PES1O00541 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PES1O00541 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PES1O00541 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PES1O00541 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PES1O00541 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PES1O00541 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PES1O00541 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PES1O00541 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms