Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF5O00463 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms