Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLRMTO00411 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms