Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TULP1O00294 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TULP1O00294 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP1O00294 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP1O00294 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP1O00294 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP1O00294 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP1O00294 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP1O00294 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP1O00294 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP1O00294 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP1O00294 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP1O00294 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP1O00294 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP1O00294 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP1O00294 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP1O00294 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP1O00294 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP1O00294 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP1O00294 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP1O00294 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP1O00294 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP1O00294 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP1O00294 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP1O00294 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP1O00294 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP1O00294 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP1O00294 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP1O00294 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP1O00294 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP1O00294 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP1O00294 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TULP1O00294 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TULP1O00294 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TULP1O00294 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TULP1O00294 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TULP1O00294 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TULP1O00294 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP1O00294 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP1O00294 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP1O00294 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP1O00294 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms