Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3KT08 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3KT08 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3KT08 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3KT08 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3KT08 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3KT08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3KT08 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3KT08 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3KT08 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3KT08 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
J3KT08 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3KT08 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms