Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMX2-CTNND1H3BSU7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms