Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NACAE9PAV3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NACAE9PAV3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms