Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UPK3BL2E5RIL1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms