Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L11C9JVI0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L11C9JVI0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms