Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4DB7Z1M9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms