Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
GGTLC3B5MD39 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGTLC3B5MD39 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGTLC3B5MD39 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGTLC3B5MD39 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGTLC3B5MD39 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGTLC3B5MD39 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGTLC3B5MD39 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGTLC3B5MD39 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGTLC3B5MD39 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GGTLC3B5MD39 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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