Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MVJ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MVJ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
A8MVJ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
A8MVJ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MVJ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MVJ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MVJ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MVJ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms