Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOBPA7XYQ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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