Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms