Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM23A6NLE4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms