Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL1A6NKG5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL1A6NKG5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL1A6NKG5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL1A6NKG5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTL1A6NKG5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL1A6NKG5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL1A6NKG5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL1A6NKG5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL1A6NKG5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL1A6NKG5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms