Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF233A6NK53 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF233A6NK53 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms