Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBY3A6NI87 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBY3A6NI87 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms