Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN8A6NHC0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms