Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms