Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms