Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms