Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM30CPA0ZSE6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM30CPA0ZSE6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms