Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLRN2A0PK11 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLRN2A0PK11 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLRN2A0PK11 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLRN2A0PK11 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLRN2A0PK11 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLRN2A0PK11 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLRN2A0PK11 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLRN2A0PK11 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLRN2A0PK11 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLRN2A0PK11 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLRN2A0PK11 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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