Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TAS1R1-202ENST00000351136 1871 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ENO4-203ENST00000409522 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CCDC175-202ENST00000537690 2616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC112492.3-201ENST00000457557 1031 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC005996.2-201ENST00000465549 564 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC005355.1-201ENST00000513329 714 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC009166.1-201ENST00000570060 487 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 MIR7-3HG-204ENST00000588758 865 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 WASH2P-201ENST00000453662 1684 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CFAP36-202ENST00000349456 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 HSPD1-201ENST00000345042 2299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 AP001150.1-201ENST00000558822 2128 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LIF-201ENST00000249075 3969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PLAT-204ENST00000429710 1655 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 AL121761.1-203ENST00000426012 677 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 LINC02105-201ENST00000504552 1003 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 AC104066.1-201ENST00000512377 751 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 ATP6V1D-209ENST00000555431 1085 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PTPRJQ12913 AP000894.1-201ENST00000584430 520 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 CELF2-AS1-201ENST00000379256 2468 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 EIF2D-202ENST00000367114 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRJQ12913 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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