Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 M1AP-209ENST00000536235 2531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CALCR-201ENST00000359558 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CDKL3-201ENST00000265334 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ACVR1-207ENST00000434821 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 OR11A1-204ENST00000641152 2440 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZNF625-203ENST00000455799 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CANT1-201ENST00000302345 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 UGDH-AS1-201ENST00000504032 2787 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FAM238A-201ENST00000412114 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TMEM159-204ENST00000572258 584 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 RASGRP4-205ENST00000586305 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TBC1D26-213ENST00000612583 1978 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CNBD2-201ENST00000349339 1927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC007342.6-201ENST00000624289 2594 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CDK14-202ENST00000380050 4995 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TCOF1-211ENST00000513346 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LRRN2-202ENST00000367176 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TM2D1-202ENST00000371177 3218 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CFB-271ENST00000425368 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CCDC40-203ENST00000374877 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZBTB24-201ENST00000230122 5519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DDX4-212ENST00000514278 2451 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC023824.5-201ENST00000564059 1766 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 C1orf64-201ENST00000329454 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 XPNPEP1-203ENST00000369683 2344 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 VWFP1-201ENST00000457911 2907 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 WDR81-201ENST00000309182 3808 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CNGB1-204ENST00000564448 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HNRNPH2-201ENST00000316594 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC092159.2-201ENST00000445418 1943 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 GSTA2-201ENST00000493422 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TTC17-202ENST00000299240 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 2191 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 GBAP1-201ENST00000368374 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SLC7A6OS-201ENST00000263997 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DRGX-201ENST00000374139 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 NKIRAS2-205ENST00000393881 1598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms