Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AGAP11-201ENST00000433214 3078 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 C1orf94-202ENST00000488417 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 EDRF1-202ENST00000356792 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 R3HDM2-205ENST00000403821 3347 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PTPRN-204ENST00000423636 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC097374.1-202ENST00000582835 3329 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SIGLEC10-207ENST00000442846 2442 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ZSCAN5A-205ENST00000587340 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NDUFA5-211ENST00000611607 1504 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 OR13A1-201ENST00000374401 2574 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC137932.3-201ENST00000602042 3660 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 KCNJ15-206ENST00000398932 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LIN54-206ENST00000506560 2757 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MUM1-214ENST00000591806 4067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 KCNAB2-203ENST00000352527 4165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC079880.1-201ENST00000603040 2046 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FMO1-201ENST00000354841 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CLIP4-203ENST00000401617 2162 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FAM71A-201ENST00000294829 2305 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ZNRD1ASP-212ENST00000420251 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 BCO2-213ENST00000531169 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 IER3IP1-201ENST00000256433 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NFXL1-206ENST00000507489 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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LSAMPQ13449 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL138921.3-201ENST00000636357 992 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PTCH2-203ENST00000447098 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 IMPDH1P10-201ENST00000440965 1542 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MAP3K7-204ENST00000369329 4911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LMO3-215ENST00000537304 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RNGTT-201ENST00000369475 1725 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ARHGAP5-AS1-201ENST00000553596 1848 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC004847.1-201ENST00000568457 1911 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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