Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN6Q9Y6Q1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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