Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPG1Q9Y678 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms