Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF18Q9Y5U5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF18Q9Y5U5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms