Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AFG3L2Q9Y4W6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFG3L2Q9Y4W6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms