Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms