Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KNSTRNQ9Y448 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KNSTRNQ9Y448 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KNSTRNQ9Y448 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms