Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms