Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms