Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms