Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms