Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms