Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4Q9UP95 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC12A4Q9UP95 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms