Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms