Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms