Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF112Q9ULX5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF112Q9ULX5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms