Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
INO80Q9ULG1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms