Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11EQ9UL52 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11EQ9UL52 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11EQ9UL52 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMPRSS11EQ9UL52 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11EQ9UL52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPRSS11EQ9UL52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPRSS11EQ9UL52 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11EQ9UL52 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11EQ9UL52 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11EQ9UL52 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms