Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms