Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GGA1Q9UJY5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms