Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms