Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR3Q9UJK0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms